2002年夏天，卡恩埃芬博格離隊 ，夺双大客卡恩成為拜仁慕尼黑隊長 。冠王這個賽季 ，职业座教卡恩的生涯授表現隻能用喜憂參半來形容 ，亮點是谢幕2002年11月至2003年2月 ，他在8輪德甲聯賽中連續802分鍾不失球 ，获聘成為當時德甲聯賽中不失球時間最長的北体門將 ，幫助球隊提前四輪奪得德甲冠軍 ，卡恩並在德國杯決賽中擊敗凱澤斯勞騰 ，夺双大客奪得雙冠王。冠王在歐冠賽場上 ，职业座教卡恩前4場小組賽狂丟8球，生涯授早早讓拜仁慕尼黑失去了出線的谢幕希望 。
後來，获聘卡恩回憶這個賽季，認為這是他職業生涯的轉折點 ，因為傷病 、自身問題以及缺乏動力 ，導致自己的表現開始下滑 。
2003-2004賽季 ，拜仁慕尼黑遭遇四大皆空 ，德國聯賽杯輸給漢堡 ，德國杯止步於八強，德甲排名第二 ，歐冠賽場上止步於16強 。需要指出的是 ，拜仁慕尼黑歐冠早早出局，與卡恩表現糟糕有直接的關係 ，1/8決賽第一回合主場1-1戰平皇馬的比賽 ，他最後時刻的低級失誤讓卡洛斯打進了扳平比分的進球 ，讓銀河戰艦拿到了一個客場進球 。不過，卡恩這個賽季也有值得紀念的時刻，2003年10月21日 ，拜仁慕尼黑客場1-1戰平裏昂的比賽 ，獅王迎來100場歐戰裏程碑；200年3月27日 ，拜仁慕尼黑主場5-2橫掃門興格拉德巴赫的聯賽 ，卡恩完成了德甲賽場上第500次出戰 。
由於球隊實力下滑 ，拜仁慕尼黑難以在歐冠賽場上開始疲軟，2004-2005賽季被切爾西擋在四強門檻外 ，2005-2006賽季1/8決賽兩回合總比分2-5輸給克星AC米蘭 ，2006-2007賽季再次被AC米蘭淘汰 ，這一次在1/4決賽輸球 。不過，在國內賽場上 ，卡恩和拜仁慕尼黑收獲頗豐 ，在2004-2005賽季和2005-2006賽季完成了德甲冠軍和德國杯冠軍的兩連霸 ，同時拿到了一個德國聯賽杯冠軍。
令人震驚的是 ，拜人慕尼黑在2006-2007賽季在德甲賽場上遭遇巨大滑坡 ，僅列聯賽第四 ，無緣參加接下來一個賽季的歐冠 。還是這個賽季 ，卡恩做出了一個決定 ，在2007-2008賽季結束後掛靴 。
在職業生涯最後的階段，卡恩因為傷病等因素 ，缺席了多達14場比賽 ，甚至在歐洲聯盟杯半決賽第二回合遭遇了奇恥大辱 ，他把守的城池被澤尼特四次攻破 ，拜仁慕尼黑0-4慘敗 ，總比分1-5出局。好在拜仁慕尼黑在德甲和德國杯兩條戰線上表現不錯，卡恩先是幫助球隊在德國杯決賽中通過加時賽擊敗多特蒙德奪冠，然後又在聯賽中奪魁 。2008年5月17日 ，德甲聯賽第34輪，安聯球場 ，拜仁慕尼黑4-1橫掃柏林赫塔 ，首發出戰的卡恩第88分鍾被換下來 ，完成了謝幕戰 ，接受全場6.9萬名球迷的掌聲 ，並在賽後與球迷進行了感染的互動 ，結束了長達21年的職業生涯。
為了表彰卡恩做出的貢獻 ，拜仁慕尼黑和德國足協聯合為他舉辦了一場告別賽 ，2008年9月2日 ，安聯球場 ，交戰雙方一邊是俱樂部球會 ，一邊是國家隊 ，卡恩代表南部之星出場75分鍾 ，這場比賽在歡快的氣氛中最終1-1握手言和。這場比賽，著名歌手保羅-帕茨專門為卡恩而來 ，並獻唱《Time to Say Goodbye》送別獅王 。數據統計顯示 ，卡恩14個賽季代表拜仁慕尼黑共計出場632次 ，零封247次 ，幫助球隊奪得22座冠軍獎杯 ，其中包括1個歐冠冠軍和8個聯賽冠軍等 。
掛靴後 ，卡恩謝絕了沙爾克04提供的俱樂部經理一職 ，而是通過學習不斷充實自己 ，他先是在2010年拿到了教練執照 ，然後在奧地利的薩爾茨堡大學念書 ，並獲得了MBA碩士學位 。2019年 ，卡恩重返拜仁慕尼黑，成為俱樂部董事會一員，並確定在2022年擔任主席一職 ，換言之 ，南部之星的未來將與獅王息息相關。值得一提的是，卡恩曾在2009年擔任央視真人秀節目的評審團 ，該節目旨在尋找中國最好的年輕守門員 。2019年7月 ，卡恩受聘為北京體育大學客座教授 。
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