2007年6月25日 ，亨利亨利在阿森納球迷事先不知情的为巴情況下轉會巴薩 ，轉會費2400萬歐元 。萨带伤搏杀欧他簽下4年合約年薪高達680萬歐元 ，冠圆合約包含“放人”的梦大满贯條款 。當然 ，阿森亨利目標很明確 ，纳上就是演老歐冠冠軍，這個時期巴薩的兵新陣容中有巴爾德斯、阿比達爾 、亨利米利托、为巴普約爾 、萨带伤搏杀欧讚布羅塔、冠圆伊涅斯塔、梦大满贯亞亞圖雷 、阿森哈維 、埃托奧 、梅西等人 ，比較一下阿森納的陣容 ，球迷都知道哪個隊更可能奪取歐冠 。
2007年7月26日 ，亨利首度披上14號巴薩球衣，在同鄧迪聯的友誼賽下半場替補登場，打進一粒點球 。在2007年9月19日歐冠巴薩3-0裏昂的比賽中，亨利取得加盟以來首個正式入球 。2007年9月29日 ，在西甲聯賽巴薩對萊萬特比賽中上演帽子戲法 ，首賽季亨利入19球 ，超過奧托奧和梅西成為最佳射手 。開局對亨利其實是喜憂參半 ！原因是在巴薩他再次退居左邊鋒 ，參與防守 ，和在阿森納時完全不同踢法 ，巴薩一貫采用433陣型，前線埃托奧居中 ，羅納爾迪尼奧偏左 ，而早期的古利及梅西則在右方策應 ，原本水銀瀉地的前鋒線在亨利加入後反而無所適從 ，亨利更喜歡做一個突擊手，迂回者 ，但卻不是典型的禁區殺手 ，不是範尼式的類型 ，亨利在隊裏也不像是在阿森納時候的關鍵人物 ，踢法上難免有些別扭 ，亨利剛好又和妻子分居 ，妻子與女兒仍留居倫敦 ，也不能很好的照顧亨利的生活 。
2008/09賽季，瓜迪奧拉執掌巴薩 ，“夢三”宣告起航 ，亨利在瓜迪奧拉的重用之下表現全麵回勇 ，與梅西和埃托奧組成的三叉戟鋒線 ，表現光芒四射 ，三人共轟入超過100球，攻擊力相當驚人。亨利在聯賽共取得19個入球，交出9個助攻。2009年5月13日西班牙國王杯決賽，球隊擊敗畢爾巴鄂奪冠 。2009年5月28日 ，巴薩和曼聯的歐冠決賽之前，亨利像以往一樣 ，吃半盒果凍 ，這個習慣一直伴隨著他。兩隊都采用433陣型，曼聯排出C羅、魯尼和樸智星組成的前場三叉戟對抗埃托奧 、梅西和亨利組合。第48分鍾 ，哈維前場直傳球漂亮的送到亨利腳下 ，法國人帶球內切入禁區晃過費迪南德後近距離勁射 ，範德薩用膝蓋將球擋出 。64分鍾 ，亨利在禁區內低射，皮球被範德薩沒收 。巴薩則依靠埃托奧和梅西在上 、下半時的各一粒入球2-0擊敗衛冕冠軍曼聯，繼1992和2006年後第三次捧起大耳聖杯 ，四年內第二次奪冠 ，就此包攬歐冠 、西甲聯賽和國王杯冠軍，成為西甲史上首個三冠王 ，亨利也完成世界足壇絕無僅有的一次“大滿貫” 。
歐冠決賽下半場亨利被換下 ，原因是他受傷了 ，而且是賽前就受傷了 ，亨利咬牙堅持了70多分鍾 ，就是不想讓別人發現這個秘密 ，這可以看出亨利不願意躺贏 ，亨利回憶說 ：“那一場比賽對我來說很特別 ，那一天是我女兒的生日 ，即使我不能彎曲我的膝蓋 ，即使我無法正常奔跑 ，但我必須堅持踢下去 ，就是這麽簡單” 。2009/10球季，隨著年輕翼鋒佩德羅受到瓜迪奧拉的提拔 ，亨利不再是巴薩的正選 ，盡管巴薩贏得聯賽冠軍 ，但整個賽季亨利可以說是在替補席上度過，出場21次隻射進4球 。亨利在巴薩三年一共進了49個球 ，2010年世界杯結束後 ，巴薩官宣亨利離隊 。
2010年7月14日，美國職業足球大聯盟球隊紐約紅牛宣布簽下了亨利 ，2011年亨利獲美國大聯盟最佳11人 ，本來人們以為亨利就此淡出頂級聯賽 ，2012年1月6日 ，阿森納與紅牛隊完成租借回歸手續 ，溫格召回了亨利 ，此時隊友已經換了一撥 ，2012年1月10日 ，英格蘭足總杯第3輪與利茲聯的比賽中 ，亨利替補出戰 ，為阿森納攻入製勝一球 ，也是亨利重返阿森納後的第一粒入球 。2012年2月12日阿森納客場對陣桑德蘭 ，亨利為阿森納攻入最後一粒英超聯賽入球 。當時桑德蘭聯賽3連勝勢頭正勁 ，第66分鍾亨利替補張伯倫上場 ，並在第91分鍾反超比分 ，當時阿爾沙文左路傳中，亨利近距離淩空墊射入網。阿森納利用進球多的優勢暫時超越同城死敵切爾西位列英超第四 ，這個進球也就理所當然成為亨利在英超的最後一粒進球 ，他為阿森納的總進球數達到了229粒 。
2013年9月，在MLS大聯盟常規賽中，紐約紅牛客場2-0戰勝多倫多 ，亨利在第31分鍾利用門前搶點為球隊首開紀錄 ，打進了個人本賽季的第9球 ，同時也是職業生涯第400球正賽進球。2014年12月16日 ，亨利宣布退役 。
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